با توجه به موقعیت استقرار کارخانه سیمان قشم و قرار گرفتن معادن غنی و سهل الاستخراج آهک و مارل در شعاع 7 کیلومتری از جمله مواد اولیه تولید سیمان محسوب می‌شود مجوز برداشت سالانه پانصد هزار تن مواد معدنی به این شرکت داده شد.

ازلحاظ چینه شناسی لایه‌های محدوده معادن مربوط به سازند آغاجاری با ضخامتی حدود 3000 متربا گستره وسیع بر روی یک پلاتفرم با پی سنگ آهک فسیل دار از نوع ریفی با تناوب واحد های ماسه سنگ آهکی ، سیلت و مارل قرار گرفته است . وجود آهک فسیل دار و مارل سبب عدم نیاز به خاک رس ، ثبات و پایداری مواد اولیه و در نتیجه امکان تولید محصولی با کیفیت عالی کارخانه سیمان قشم را به رقیبی سرسخت در بازار داخلی و خارجی سیمان ایران تبدیل کرده است